Les Rétaires forment un groupe monophylétique au sein des Rhizaires comprenant principalement les foraminifères et les radiolaires. Ces organismes sont caractérisés par des pseudopodes filamenteux et réticulés permettant la phagocytose efficace de particules alimentaires. Les foraminifères, avec leurs tests calcaires, contribuent significativement aux dépôts carbonatés marins, influençant la dynamique des cycles du carbone et des sédiments océaniques. En parallèle, les radiolaires, producteurs de squelettes siliceux, jouent un rôle crucial dans la biogéochimie de la silice. L’étude des fossiles de rétaires permet des reconstitutions précises des paléoenvironnements et fournit des données essentielles pour la compréhension de l'évolution des écosystèmes marins à l’échelle géologique.

Les Rhizaires constituent un groupe monophylétique au sein des SAR, caractérisé par des pseudopodes filamenteux ou réticulés, permettant la phagocytose de particules alimentaires. Ce groupe comprend les foraminifères, radiolaires et chlorarachniophytes, chacun ayant une importance écologique et géochimique distincte. Les foraminifères, par exemple, forment des tests calcaires dont l’accumulation dans les fonds marins contribue de manière significative au cycle du carbone inorganique et à la stratigraphie marine. Les radiolaires, quant à eux, construisent des squelettes siliceux qui constituent une part importante des dépôts de silice dans les océans profonds, impactant les flux de silice globaux.

Les Harosa, ou SAR, forment un super-groupe monophylétique d’eucaryotes qui inclut les Stramenopiles, Alveolates et Rhizaria. Ce groupe est caractérisé par une diversité génétique et morphologique remarquable : les Stramenopilescomprennent des phototrophes importants (ex. diatomées), les Alveolates incluent des lignées hétérotrophes et phototrophes (ex. dinoflagellés), et les Rhizaria rassemblent des amibes à pseudopodes. Ces organismes contribuent au fonctionnement des écosystèmes marins et d’eau douce, occupant des rôles de producteurs primaires, de recycleurs de nutriments, et de prédateurs microbiens. Leurs rôles dans la biogéochimie marine et leur complexité phylogénétique font des Harosa un sujet d’étude essentiel pour comprendre la diversité eucaryote.

Les Chromalvéolés constituent un groupe monophylétique potentiel d’eucaryotes, comprenant les Alvéolés (ex. Dinoflagellés, Apicomplexés) et les Straménopiles (ex. diatomées, algues brunes). Ce groupe est supposé avoir acquis des plastes d’une endosymbiose secondaire avec une algue rouge, donnant lieu à une diversité trophique allant de la photosynthèse aux formes parasitaires. Les Chromalvéolés jouent un rôle écologique crucial en tant que producteurs primaires, régulateurs de cycles biogéochimiques, et parfois pathogènes pour les animaux et les humains, tels que Plasmodium, le protozoaire causant le paludisme.

Les bicontes sont un groupe d’organismes eucaryotes, qui possèdent deux flagelles pour se déplacer. Ce groupe comprend principalement des algues et des protistes. Beaucoup de bicontes utilisent la photosynthèse pour transformer la lumière en énergie, ce qui les rend essentiels dans les écosystèmes aquatiques pour produire de l’oxygène et nourrir d'autres organismes.

Les eucaryotes sont des êtres vivants dont les cellules ont un noyau, c'est-à-dire un endroit spécial où se trouve le matériel génétique. Ce groupe comprend des plantes, des animaux, des champignons et des micro-organismes. Les cellules eucaryotes sont plus organisées et possèdent des parties appelées organites qui ont chacune un rôle précis. Cela les rend plus complexes que les cellules des bactéries.